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飞虎队督察Mike（王敏德）被下放到环境复杂的红番区后，成为一群散漫的生番警察的领导，这群人中尤其烂鬼东（黄秋生）最让他头痛，此人曾殉私让其杀了人的黑帮好友Roy（张耀扬）潜逃，初来乍到时，Mike吃尽他带头搞的苦头。Roy的心腹图钉华（谭耀文）借大佬潜逃坐上第一把交椅 ，成为Mike等人眼中的头号敌手。
Mike为找图钉华犯罪证据监视YoYo时，与之生出真情。偷渡回港的Roy得知被Mike戴了绿帽子后，气急败坏欲找Mike报仇，不想被图钉华一刀劈死。烂鬼东得知好友死讯后立时大怒，独自一人闯入图钉华老巢，刑警即可变作野兽。
这部《雄霸天下》的故事紧接《岁月风云》展开。陆云生（吕良伟 饰）场面做大，他为人重情义不计开销导致入不敷出，遂计划涉足银行业，岂料上海各银行家集体抗拒。陆请动古羽（苗侨伟 饰）协助，终令银行家们低头服输……1937年，政府推行“新生活”运动，陆云生放弃鸦片生意带头戒毒，结果险些丧命，不久卢沟桥事变爆发，陆云生为支持抗战捐赠战机，却仍没有挽回上海沦陷的结局，是役更导致他众多门生身亡。陆云生为躲避日本人暂居香港，期间黄金荣（郑则仕 饰）留沪装傻；袁肃军（徐锦江 饰）投靠日军成为汉奸，陆云生只得派出阿山（汤镇业 饰）刺袁。
抗战终于胜利，陆云生有望成为上海市长，让他颇感欣慰，但冷酷的现实是他已失去利用价值，一代枭雄在不属于他的时代渐入穷途……。
警界老油条阿辉（周润发 饰）生性风流，凭借自己父亲昔日手下沾叔（黄沾 饰）的维护，阿辉在警局虽然得不到升迁，但也落得清闲。新进警员曹里昂（李元霸 饰）的到来打破了这一切，曹大胆甚至莽撞的办案方式连累阿辉大出洋相，阿辉虽恨曹里昂，但碍于上司命令，不得不与曹搭档。
与此同时，毒枭罗茂森（徐少强 饰）的手下毒蛇炳将其交易的毒品调包私自出售，毒蛇炳之妹当娜（利智 饰）配合售毒。兄妹二人非法入港相依为命，希望藉由毒品生意改善生活。罗茂森团伙杀人引起警方注意，阿辉与曹里昂两人接手此案，他们很快从当娜身上得到了线索。而罗茂森亦发现毒蛇炳偷梁换柱的所为，一时间阿辉与罗茂森展开了对当娜的争夺……
黑社会组织成员韦吉祥（刘德华）因突发纷争砍伤仇家丧波惹上麻烦，在曾心仪许久的大律师Sandy（梁咏琪）的帮助下，他的麻烦得以摆脱，丧波被判入狱五年，但他的妻子亦被人撞死。独自抚养爱子大洪（余文浚）的韦吉祥拙手笨脚，与大洪摩擦不断，幸得红颜知己Ruby（关秀媚）从中调解，两人关系渐变和谐。
为了大洪，韦吉祥有心退出江湖，令组织老大对他越来越不爽。丧波刑满出狱，与组织老大联合起来展开复仇行动，身不由己的韦吉祥只能勇敢地站起来应战，然而一切还是无法控制越变越糟糕。
英雄警察陈家驹（成龙 饰）又回来了。不过，性格火爆、直言不讳的他这次因为不满意上司放走了一个极其危险的重犯而和上司吵翻了，愤然辞职。脱离了警察生活的家驹和女友去旅行期间，一间电话公司遭到了炸弹恐吓，本性难移的家驹马上赶到了现场，着手调查案件。
岂料一波未平，一波又起。这个炸弹狂徒竟然炸毁了警局的大门，还绑架了家驹的女友，要求家驹携带大量赎款前往货仓交换人质。当家驹身带巨款抵达货仓时，发现这里已经布满了炸弹……
这是香港80年代的典型黑帮片。这次，黑道老大龙哥派出得力杀手阿伦（谭咏麟 饰）赴台暗杀当地的毒枭，老二白狼认为龙哥信不过他，因而心生不满。白狼手下阿徐则早就想自立门户，于是假借白狼的名号暗中贩毒。阿徐得知龙哥的次子嗜毒如命，逐设下圈套引他上钩，逼他运毒。在黑社会一场混战中，龙哥不幸身亡，阿徐乘机血洗灵堂，一举消灭了龙家的人和依附的黑社会势力。龙哥的贴身保镖肥宝与龙哥的第六个儿子（刘德华 饰）因为刚好不在而逃过大难，一场复仇行动展开了。
吕菁生长在一个黑社会的家庭，父亲吕龙在江湖上甚至有地位，大哥娶妻生子，然而风流成性，二哥义火爆，幸好二嫂为人冷静机智，常从旁协助，三哥勇娶了一个日本女郎做妻子，鸡同鸭讲，常产生笑话。此外，吕菁还有一个四姐莺泼辣冲动，与父亲的妾侍兰姨及其女儿常生摩擦。而母亲与兰姨的关系良好。吕菁一直在英国读法律，结识石子傲，很快就坠入爱河。结婚后决定回港渡蜜月，也因为她这次回来，为吕家带来一场浩劫。一天晚上，当吕龙和两个儿子一起欣赏京戏时，杀手掩至，戏院内发生剧战，二哥，三哥护着父亲撤退，结果中伏，三哥和父亲当场丧命，二哥亦身受重伤。与此同时，大哥与情妇偷欢时遇害……
廉政公署揭破有史以来最巨规模之黑金选举行贿贪污丑行案件，轰动整个东南亚，廉署再捷一功，新界某乡事执委员会主席何权，获悉特区政府准建设西铁发展计划事宜，确定沿线发展区域一带，大量拨地兴建丁屋，串谋某干乡事执委周甘铨、罗伟雄、梁召权、赵振明等人，进行非法行贿认定原居民，以厚利报酬而换取支持投票当选为主席，以便日后进身立法机关执法，好待以主席身份代表乡民向特区政府商议土地收购索偿。廉署高层干部接获此案，据案情涉及西铁发展计划，牵涉人仕甚广，随即成立项目小组调查此案，并设立代号为“西域黑金”行动。
